La Métallurgie CFE-CGC est structurée en 6 syndicats nationaux : syndicat AED (Aéronautique, Espace Défense), syndicat Sidérurgie, syndicat SNEPIE (industries informatique et électronique), syndicat du Nucléaire et activités connexes (SN NUC), syndicat de l’énergie atomique (SICTAM-CEA) et celui de la construction navale militaire DCNS.